Struktur Organisasi
STIPER Santo Thomas Aquinas dikelola dengan sifat dasar organisasi untuk menunjang pencapaian visi dan misi Perguruan tinggi dan tanggap terhadap perkembangan di dalam maupun di luar lingkungan perguruan tinggi.
Organisasi dan Para Pengelola di lingkungan STIPER Santo Thomas Aquinas, sebagai berikut:
Ketua
Dr. Yunus P. Paulangan, S.Kel., M.Si
Wakil Ketua I Bidang Akademik
Dr (Cand.) Herman Tangkelayuk, S.P., M.Si
Wakil Ketua II Bidang Administrasi Umum & Keuangan
Fatalina Welerubun, S.Sos, M.AP
Wakil Ketua III Kemahasiswaan & Alumni
Everd Hengga, S.Pi., M.Si
Wakil Ketua IV Humas, Inovasi & Kemitraan
Samuel Jeujanan, S.Pi., M.Si
Kepala Lembaga Penelitian & Pengabdian Masyarakat (LPPM)
Dr. Selvia Tharukliling, S.Pt., M.P
Kepala Lembaga Penjaminan Mutu & Kurikulum
Ir. Kornelius L. Nuhon, M.Si
Program Studi Agroteknologi:
Ketua : Dominggus M. D. Tatuhey, S.P., M.P
Sekertaris : Jacob J. Lawalata, S.P., M.Si
Program Studi Agribisnis:
Ketua : Dr (Cand.) Laurentius H. Maturbongs, S.P., M.Sc
Sekertaris : Yunus Paelo, S. P., M.Si
Program Studi Peternakan:
Ketua : Ir. Merpati, M.Si
Sekertaris : Ristasari Saadi, S.Pt., M.Si
Program Studi Akuakultur:
Ketua : Robertus Ngantu, S.Pi., M.Si
Sekertaris : Jolanda Sitaniapessy, S.Pi., M.Si